Высшим органом управления организации является Совет Миссии. Постоянно действующим исполнительным органом организации является Директор, назначаемый Советом Миссии на постоянной основе. Общее руководство образовательной деятельностью осуществляет Образовательный отдел «Евроазиатский колледж».